Biologie je na naší škole vyučována první tři roky na čtyřletém gymnáziu, prvních pět let na gymnáziu šestiletém a od primy do septimy na osmiletém gymnáziu. Studenti získávají v průběhu studia základní informace z biologických oborů, jako je např. botanika, zoologie, ekologie, biologie člověka, obecná biologie, genetika, mineralogie a petrografie.
Výuka biologie je doplňována pravidelnými nebo svolávanými laboratorními pracemi, exkurzemi do botanické a zoologické zahrady, Hrdličkova a Národního muzea, různými výstavami a expozicemi, besedami s odborníky, patologicko-anatomickými pitvami, spoluprací s PřF UK a VŠCHT, projektovými dny, volitelným biologickým kurzem nebo geografickobiologickou expedicí, přírodovědným kroužkem a akcemi přírodovědného klubu.
Biologii vyučuje na škole devět aprobovaných učitelů, někteří z nich také pracují ve funkci fakultních učitelů pro PřF UK. Našemu gymnáziu je přidělen statut fakultní školy PřF UK.
Biologie se vyučuje v odborných učebnách vybavených dataprojektory, počítači, interaktivními tabulemi, videem, binolupami, mikroskopem s kamerou, žákovskými mikroskopy, příležitostně i čidly Vernier a různými pomůckami pro výuku laboratorních prací. Jsou využívány nejrůznější výukové programy a další materiály.
Na maturitu z biologie a přijímací zkoušky na různé typy vysokých škol jsou studenti připravováni na jednoletých seminářích v předposledním a posledním ročníku. V rámci seminářů v předposledním ročníku zpracovávají a prezentují seminární práce.
V prvních čtyřech ročnících osmiletého gymnázia a prvních dvou ročnících šestiletého gymnázia pracujeme podle učebnic Přírodopis I - IV (nakladatelství Scientia). Vyšší ročníky gymnázia se učí podle moderních učebnic autora P. Šímy vydaných nakladatelstvím Educo.
Dlouholetou tradici má na naší škole soutěž SOČ (patříme mezi první školy, které se zúčastnily před 35 lety prvního ročníku soutěže). Studenti prezentují své práce v oborech biologie, chemie, geologie a geografie, zdravotnictví a ochrana a tvorba životního prostředí. Za posledních několik let se můžeme pochlubit úspěchy v regionálním i celostátním kole.
Každým rokem organizuje předmětová komise Biologickou olympiádu ve všech soutěžních kategoriích. Zájem studentů je velký, výrazných úspěchů dosahují především studenti nižších ročníků osmiletého gymnázia. Na naší škole se také pravidelně pořádají obvodní kola Biologické olympiády. Pro druhé ročníky čtyřletého gymnázia a sexty je organizována Botanická soutěž. Příležitostně se žáci zúčastňují i dalších soutěží, např. Přírodovědného klokana.